Le bassin versant du Tarn-amont s’étend sur 2 627 km² des sources du Tarn jusqu’à la confluence avec la Muse à l’aval de Millau.
En tête de bassin, les Cévennes (massifs du Mont-Lozère et du Mont-Aigoual), de par leur nature cristalline (granites et schistes), sont caractérisées par de nombreuses sources et un chevelu de cours d’eau très dense. Plus en aval, les causses, ces vastes plateaux calcaires à l’altitude moyenne de 1 000 m, couvrent près des 2/3 du territoire et sont entaillés par de spectaculaires gorges de 400 à 500 mètres de profondeur, creusées entre autres par les rivières du Tarn, de la Jonte et de la Dourbie.
Outre une multitude de routes départementales et communales, des axes routiers d’intérêts nationaux traversent les milieux fragiles du bassin versant du Tarn-amont : l’autoroute A75 sur les systèmes karstiques et la route nationale 106 sur les têtes de bassin cévenoles.